年5月26日，国际权威学术杂志《Cell》杂志在线发表了美国斯坦福大学KerwynCaseyHuang、齐磊博士与加州大学CarolA.Gross研究员的一篇研究论文，研究报道研究人员利用CRISPR干扰技术，对枯草杆菌的必需基因进行了全面的功能分析。
文章中，齐磊和合著作者们指出必需基因发挥功能支持了核心的细胞过程。调查必需基因功能之间的关系对于认识控制细菌生长的机制，以及推动药物开发至关重要。然而，当前只有少数几种方法可用来在体内评估必需基因功能阐明它们的关系。由于必需基因丧失功能会导致细胞无法生存，无论是基因缺失文库还是饱和转座子诱变都不能用来研究必需基因。有几种高通量方法已被用于鉴别或扰乱真核生物中的必需基因，包括使得mRNAs3′UTR失稳，CRISPR/Cas9基因编辑，和CRISPR/dCas9转录调控技术。当前唯一在细菌中筛查必需基因的研究利用了反义RNA敲低来筛查抗生素敏感性，由于效率多变这一方法的功用受到限制。
在新研究中，研究人员利用CRISPRi来敲低枯草杆菌中每个必需基因，探究了它们的表型。他们利用化学基因组学建立的高可信度必需基因网络显示了关系遥远的一些过程之间广泛的相互联系，确定了一些未确定特征的抗生素的作用模式。重要地是，研究人员发现轻微敲低必需基因功能可显著降低静止期存活而不影响最高生长速率。最后，高通量显微镜分析表明，细胞形态对于轻微敲低相对不敏感，而受到删除基因功能的显著影响，揭示了细胞生长与形态之间的密切联系。
新研究为在体内系统调查必需基因功能提供了一个广泛适用于各种微生物和比较分析的一个框架。
原文链接：
AComprehensive,CRISPR-basedFunctionalAnalysisofEssentialGenesinBacteria
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