今天，亲爱的师妹很烦恼，实验室测序了一个样品，公司发回来一个列表，上面是一堆microRAN,老板希望知道这些microRAN已经被验证过的功能，然后可怜的师妹就开始在pubmed里搜文献，最后发现每一个microRNA都有好几页的靶基因，顿时崩溃了。。。。
师妹不懂啥R语言，怎么教他个简（tou）单（lan）的方法完成老板的任务呢？！
首先我们要知道：miRNA是非编码的，所以要知道其功能，需要先知道其靶基因，而目前靶基因有2种来源，一类是通过实验做出来的，可以从miRTarBase和TarBase获得，这类数据库是通过整理发表文献而来，假阳性低但有实验偏好的差异。另一类是通过算法预测的，这样的数据库和算法有很多，比如TargetScan,miranda,PicTar等等，但毕竟是通过特点预测的，假阳性率就非常高。所以有人建议整合多个靶基因预测数据库会显著降低假阳性率，整合数据库如mirDIP等。
在通过以上方法获得靶基因后，就可以用之前我们提到的很多方法，经典的是寻找差异分子案例实践——富集分析上（七）寻找差异分子案例实践——富集分析下（八）把靶基因富集到相应的功能通路上，那些通路上有越多的基因在上面，越说明这个样品有可能是在这条通路上起作用，并具有该功能！
师妹实在不想查文献，那就用miRTarBase和TarBase吧，两者都直接整合了文献已经证明的靶基因（包括qPCR、Westernblot、Reporterassay等方法）。
以miRTarBase做个简单介绍，miRTaebase是台湾同胞搞的一个专门收集有实验证据支持microRNA及其靶基因间关系的数据库。目前更新到年9月。
靶基因可以根据实际需求多种方式进行检索：
1.以microRNA名字，人性化的是可以以miRNAFamily的形式，你懂得，像Let7，真TMD有的太多了。
2.基因反查
3.信号通路
4.被验证的方式
5.根据疾病
6.根据文献
结果页面显示验证的方式和文献篇数，点击即达。
所以，以后就别再傻傻查文献去找micrRNA的靶基因了哈（或者偷个懒只查年9月之后的哈）。
论文信号通路图，模式图，全搞定
谷歌不能上？有这个，一劳永逸
临床统计傻瓜式解决
外文写作润色神器
不花钱下载SCI全文黄金攻略！
PubMed有哪些被你忽视的细节？
SCI文献管理之黄金攻略！
卸载Visio—超赞的在线流程图制作工具
论文查重！关键是不要钱！
神器！分分钟找到高质量的目标文献！
生存分析从理解到作图妥妥的
科研作图神器GraphPad
菜鸟写国自然-4：立项依据的写作
零基础不一样的实验protocol:开篇引言
引物设计？现成的随便拿啦！
实验技能：小鼠尾静脉注射
Western百败百战老学姐的心酸笔记
零基础Meta系列（十）：一般套路(纯干货)一盏茶一篇meta（四）—SNPMeta，数据库寻找靶基因
网状meta分析（NMA）-第一卷基本技能
段子手韩春雨老师
不得不扒的女神--胡海岚
扒一扒你所不知道的浙大PMCB团队（内嵌新春大红包！）实例讲解:基因数据库的利用（二）
生物医学大数据解读和分析——构建生物网络实践
科研路，不孤单！^^
Freescience医学科研联盟全国火热招募ing
50医院的小伙伴已经加入啦，点这里
Bioart/Freescience科研沙龙，详情进入沙龙QQ群，点这里（进入后，扫底部
