批量miRNA的靶基因预测,不用代码怎么

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今天我们不介绍文章了,回答一个问题:批量miRNA的靶基因预测,不用代码怎么实现?

具体来说是这样的:有同学说在做数据分析的时候通过GEO的芯片分析找到了几十条显著差异的miRNA,想对这些miRNA进行靶基因预测,下面是22条举例的miRNA:

我们可以看到这里出现了miRNA的名字,但是出现了星号*等标记,我们前面在miRNA的名字,到底是什么意思?和3p还是5p,有必要区分吗?中说过,对于大多数miRNA来说,如果编号一样但3p和5p不同,其功能及调控的靶基因可能都是不同的,如miR--3p和miR--5p(通过mirbase查询):

我们看到miR--3p和miR--5p的序列是不同的,而两条miRNA的previousID分别是hsa-miR-和hsa-miR-*,而平时我们在文章里面经常见到的很多时候都是只出现hsa-miR-或者hsa-miR-*,

而不出现具体的3p还是5p信息,因此当我们看到这样信息的时候就可以通过mirbase(


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