今天是第期日报。
粪便病毒组移植的前景与局限（综述）FEMSMicrobiologyReviews[IF:13.92]
①肠道中的噬菌体能感染细菌完成复制，通过无菌过滤粪便中的细菌成分进行粪便病毒组移植（FVT），可降低细菌感染风险；②噬菌体群落介导的FVT能引起宿主代谢组、菌群结构变化，改善宿主健康，如治疗IBD、肥胖症和二型糖尿病等；③FVT干预需考虑：噬菌体效价、供体的选择，噬菌体携带的毒性基因，及对宿主潜在的不良免疫反应等；④目前缺乏直接比较FVT与FMT有效性和安全性的研究，未来也需探究细菌和噬菌体间的互作，以确定起作用的噬菌体。
Bacteriophage-mediatedmanipulationofthegutmicrobiome-promisesandpresentslimitations06-04,doi:10./femsre/fuaa
噬菌体是粪便病毒组的主要成员，能感染细菌，进而操纵肠道菌群，影响人体健康。FEMSMicrobiologyReviews近期发表的一篇综述，讨论了用无菌过滤的供体粪便(含病毒、代谢物和细胞碎片，但不含完整的细菌细胞)替代FMT进行干预，对治疗IBD（炎症性肠病）、肥胖症和2型糖尿病等疾病的可能性，并阐述了噬菌体是如何通过FVT在肠道微生物组中发挥关键作用的。最后，文章还指出了未来使用FVT干预时应考虑的因素及安全隐患。值得一读！（
nana）噬菌体疗法面临哪些挑战？如何应对？（综述）JournalofControlledRelease[IF:7.]
①工程噬菌体操控肠道微生物组有一定的挑战，主要体现在4个方面；②噬菌体细菌靶向特异性：可从自然资源中分离多价噬菌体，筛选仅针对目标细菌的噬菌体，并利用噬菌体工程改变宿主范围等；③克服细菌先天免疫以保护转导DNA：如克服基于DNA裂解和非DNA裂解的细菌免疫，使转导DNA长期保存；④基因表达量的调控：利用通用细菌表达资源系统及稳定表达系统调控目标基因表达；⑤重组DNA安全性的控制：利用主动、被动系统，确保重组DNA的安全性。
Challengesopportunitiesforphage-basedinsitumicrobiomeengineeringinthegut06-19,doi:10./j.jconrel.2.06.
利用肠道中丰富的微生物生态系统，或可通过使用改造过的噬菌体在原位对微生物组进行基因改造。JournalofControlledRelease发表的综述，提出了利用工程噬菌体控制和操纵肠道微生物组所面临的挑战，如细菌靶向特异性、转导DNA的长期作用、基因表达调控、重组DNA安全性控制等。针对这些挑战，文章进一步提出了应对这些挑战的可操作性方法，以帮助发展基于噬菌体的原位微生物工程这一新兴领域，并力图在未来将其推展到临床。（
nana）Cell子刊：宏基因组数据分析，如何助力噬菌体疗法？CellHostandMicrobe[IF:15.]
①对名健康日本人的肠道病毒组和细菌组进行测序；②基于噬菌体和CRISPR的分析方法，对来自同一粪便样品的细菌和病毒的基因组序列，进行细菌-噬菌体关联分析，阐明了温和噬菌体和烈性噬菌体与宿主细菌的关系；③宏基因组数据分析筛选出艰难梭菌特异性噬菌体，并鉴定出一种噬菌体来源的抗菌酶；④体外实验表明抗菌酶对艰难梭菌有溶解能力，在艰难梭菌感染小鼠模型中，抗菌酶可特异性降低小鼠死亡率。
MetagenomeDataonIntestinalPhage-BacteriaAssociationsAidstheDevelopmentofPhageTherapyagainstPathobionts07-10,doi:10./j.chom.2.06.
噬菌体疗法是消除肠道有害细菌的高度特异性治疗方法。然而，噬菌体和肠道细菌之间的感染关系尚未完全阐明。CellHostandMicrobe发表的一篇文章，对个健康日本人的肠道病毒组和细菌组进行了宏基因组分析，鉴定出能特异性控制病原微生物的噬菌体来源抗菌酶。利用抗菌酶干预艰难梭菌感染的小鼠，可以显著提高小鼠的成活率。本研究结果表明，基于宏基因组分析的宿主细菌-噬菌体关联信息，有利于改造噬菌体以消灭病原菌，并为开发各种与肠道菌群失调相关疾病的治疗方法提供借鉴。（
nana）噬菌体治疗肠道细菌感染的新思路mSystems[IF:6.]
①细菌耐药性水平增加对细菌感染治疗带来挑战，可开发一种基于基因组水平的温和噬菌体疗法，在不杀死细菌的前提下降低细菌毒力因子的表达；②使用工程温和噬菌体λBH1可以抑制肠道细菌毒力因子的表达，并且使其宿主E.coli保持溶原状态；③λBH2遗传修饰后，可以克服细菌中其它噬菌体的重复感染排斥效应；④λBH2与E.coliW体外共培养，可以抑制志贺毒素基因的表达；⑤小鼠实验表明λBH2噬菌体能降低E.coliW中志贺毒素产生。
StableNeutralizationofaVirulenceFactorinBacteriaUsingTemperatePhageintheMammalianGut01-28,doi:10./mSystems.-20
mSystems发表的一项研究，使用一种温和的噬菌体（一种能将自身基因组整合到细菌基因组中的噬菌体），通过在遗传水平上修改细菌的功能，来抑制毒性因子的表达。结果表明，单剂量的工程噬菌体可以在细菌中繁殖，并在肠道感染小鼠模型中减少志贺毒素的产生，且不会显著影响细菌浓度。本研究或提供了一种治疗肠道细菌感染的新思路。（
nana）Nature子刊：如何靶向改变肠道菌功能？口服递送噬菌体来帮忙NatureCommunications[IF:12.]
①表达核酸酶失活的Cas9的工程温和噬菌体λ，可在体外靶向抑制大肠杆菌基因表达；②给定殖了大肠杆菌的小鼠，灌胃工程噬菌体进行干预，噬菌体可抑制大肠杆菌的基因表达，并且不会显著降低大肠杆菌浓度；③开发了基于微生物可降解的聚合物薄膜（外表采用抗酸的薄膜涂料），可在不影响噬菌体功能的情况下，保证噬菌体顺利到达大肠；④且能最大限度地提高口服给药的效果、减少潜在的生理肠道菌群结构破坏，实现肠道菌基因表达的精准调控。
Insitureprogrammingofgutbacteriabyoraldelivery10-06,doi:10./s---2
调节肠道细菌功能可能是促进肠道健康的有效方法，但由于肠道的不可侵入性以及肠道细菌与宿主之间的相互联系，很难在不破坏微生物群和/或宿主生理的情况下精确定位细菌的功能。Nature
