今天跟大家分享的是三月11日发表在clinicalcancerresearch（IF：8.9）杂志上的一篇关于头颈癌免疫浸润亚型文章。文章整合了多组学、多平台数据进行分析，很值得学习哦！扫码咨询更多多组学免疫浸润思路Integrativeanalysisofmulti-omicsdataidentifiedEGFRandPTGS2askeynodesinageneregulatorynetworkrelatedtoimmunephenotypesinheadandneckcancer
多组学数据综合分析识别头颈癌免疫表型相关的调控网络中关键节点：EGFR、PTGS2
目的：肿瘤的恶性进展表现出免疫效应和耐受的紧密协调的平衡。然而驱动肿瘤免疫表型的形成和维持的分子原理仍有待阐明。实验设计：基于PD-L1andIFN-g表达相关的免疫细胞子集训练了新的分子分类器，该分类器可区分高（clusterA）或低细胞免疫毒性(sub-clusterB3)子集。该研究基于多组学数据综合性分析以确定遗传和表观遗传景观差异，以及对不同免疫表型之间差异表达基因的影响。使用LASSO-Cox回归模型构建了免疫检查位点抑制（ICI）的预后基因标志。结论：研究使用的数据突显了肿瘤免疫表型建立过程中遗传和表观遗传事件之间的复杂相互作用，并提供了ICI治疗失败风险较高的HNSCC患者可能是由于EGFR的抑制实验证据。材料和方法一、表达和临床队列1、TCGA：33个独立TCGA癌症队列的RNA表达及临床数据：