OSToolsGO富集分析工具有新功

我们的OmicShareTools云平台的GO富集分析工具自推出以来,就一直受到大家的热烈欢迎,截至目前为止,已经使用上次了。但很多小伙伴苦于不知道如何得到背景基因的GO注释,咋办呢?

对于无参考基因组的物种,只能靠自己先去进行GO注释。对于有参考基因组的物种,有很多方法都可以下载物种的GO注释的,但大部分小伙伴还是不知道~~因此,我们贴心地将9种模式物种的基因ID和基因GO注释信息加入到GO富集分析工具中,从此,如果你要分析的物种刚好是这9种之一,你只需要上传需要富集的目的基因ID文件,然后选择相应的参考基因组就可以轻松地进行GO富集分析了!

这9种模式物种分别是:

水稻(两个亚种)、拟南芥、小鼠、大鼠、斑马鱼、原鸡、人、秀丽线虫、果蝇。

选择好物种后,根据富集目的基因的ID选择参考基因ID或参考转录本ID(注意前景基因和背景基因的ID要保持一致),如果不清楚参考的ID是怎样的,可以点击“预览参考文件”进行查看。

最后面的版本号是Ensemble的版本号,不用管。

比如我有拟南芥的差异表达基因,想对这些基因进行GO富集分析。那么轻松两步就可以获得GO富集分析的结果了:

01

上传富集目的基因文件:

02

选择参考基因组

勾选“使用已有参考”,选择相应的物种、类型。因为我的目的基因ID是拟南芥的基因ID号,因此类型那里我选择了“基因”。然后提交任务,就OK了!

结果

结果和平时的没什么差异:

大家快去试用一下GO富集分析工具的新功能,觉得好用可以推荐给朋友噢!

培训班详情









































长春白癜风医院
中科让您寒假告别白癜风



转载请注明:http://www.bjgongshangzhuce.com/jyzl/5587.html


当前时间: