1.Cell:新工具Repair-seq可用于改进CRISPR基因编辑doi:10./j.cell..10.通过改变活细胞内的DNA序列来编辑基因组的能力对于研究来说是非常强大的,并为疾病的治疗带来了巨大的希望。然而,现有的基因组编辑技术经常导致不必要的突变,或者根本无法引入任何变化。这些问题使该领域无法发挥它的全部潜力。如今,在第一项新的研究中,美国普林斯顿大学研究员BrittAdamson、麻省理工学院生物系教授JonathanWeissman、之前在EditasMedicine公司工作的CeciliaCotta-Ramusino及其同事们详细介绍了一种名为Repair-seq的新方法,它详细地揭示了基因组编辑工具如何发挥作用。相关研究结果发表在年10月28日的Cell期刊上,论文标题为“MappingthegeneticlandscapeofDNAdouble-strandbreakrepair”。
图片来自Cell,,doi:10./j.cell..10.。为了修复DNA,细胞使用了许多不同的机制,每种机制都涉及到一系列在不同途径中协同工作的基因。Repair-seq允许人们通过同时分析数百个基因如何影响在受损部位产生的突变,来探测这些途径对修复特定DNA损伤的贡献。这些作者随后可以构建DNA修复的机制模型,并了解这些机制如何影响基因组编辑。Adamson及其同事们将他们的方法应用于最常用的基因组编辑方法之一,即CRISPR-Cas9,后者采用细菌Cas9核酸酶切过双链DNA分子的两条链,从而产生称为双链断裂的DNA损伤。Repair-seq实验产生了大量的数据。由Hussmann领导的对这些数据的分析,产生了不同的DNA修复途径如何与特定类型的Cas9诱导突变相关联的图谱。在该领域丰富的研究历史基础上,Hussmann的分析阐明了已经知道的途径,并确定了新的途径,这些途径共同突出了参与双链断裂修复的巨大复杂性和一系列系统。这项研究中分析的一组深层数据如今被发布在一个在线门户网站(