在农业研究领域，尤其是大宗作物、家畜、家禽等的育种工作中，新种质培育和优异性状等位基因的定位与克隆，一直是科研工作者攻关的重要方向之一。遗传育种经历过数个阶段，如早期人工选择、杂交育种等，进入新世纪以后基因测序技术方兴未艾，在当前主要是以大的分化群体、结合高通量测序技术（NGS）和生物信息学分析方法，利用计算机手段定位目标性状关联基因组区域，进而开发连锁标记直至克隆基因，以应用于分子标记辅助育种（molecular-assistedselection,MAS）。
NGS测序基因定位方法，根据应用场景也对应了多种不同手段，遗传图谱基因定位则是其中应用较广的技术之一。遗传图谱（GeneticMap），狭义上应该属于一种基因组作图技术，即利用试验或测序手段开发的分子标记（如SNP、InDel、SSR等），根据标记间的重组概率计算遗传图距（1%重组率=1图距单位cM），继而确定它们在基因组中的位置并划分成不同连锁群（linkagegroup,LG，大致与染色体对应）。典型遗传图谱样式参见图1：
图1遗传图谱
遗传图谱基因定位技术，即通常针对遗传（家系）群体，合理挑选样本进行测序，开发分子标记、构建遗传图谱，进行数量性状基因座（quantitativetraitloci,QTL）定位的实验分析方法。遗传图谱QTL定位实验通常分为以下几步：
一，群体构建。遗传群体，或者叫家系群体，通常指由两个（或多个）表型存在显著差异的亲本，杂交后再连续自交，得到的包含数百（至数千）个株系、目标性状存在双向分离的后代集合。遗传群体的主要类型，包括F2（杂交子二代）、F2:3、回交群体（back-crossing,BC）、双单倍体群体（doublehaploid,DH）、重组自交系（re
