顺式调控元件是基因旁侧序列中能够影响基因表达的序列。作物的遗传图谱研究结果表明，远距离基因间的位点与农艺性状间具有一定的作用。因此这些位点具有潜在的应用价值，然而，我们对它们的具体作用还不是很清楚。最近，美国佐治亚大学的研究人员从遗传、表观基因组和功能分子方面提供了系统的证据，证明这种基因间位点能够作为长距离转录顺式调控元件（CRE）在玉米基因组中发挥作用。
研究发现，这些位点能够富集常染色质特征，这表明了它们的调控功能。染色质环将假定的CRE与基因连接在一起，说明了他们之间会有遗传互作。通过自转录活性调控区测序，研究者发现假定的CREs同时也显示出升高的转录增强子活性。
该研究为CRE的广泛存在提供了证据，这些CRE会跨越较大的基因组距离来控制基因的表达。
NaturePlants,18November
Widespreadlong-rangecis-regulatoryelementsinthemaizegenome
Author
WilliamA.Ricci,ZefuLu,LexiangJi……NathanM.Springer,RobertJ.SchmitzXiaoyuZhang*
*:DepartmentofPlantBiology,UniversityofGeorgia,USA
Abstract
Geneticmappingstudiesoncropssuggestthatagronomictraitscanbecontrolledbygene-distalintergenicloci.Despitethebiologicalimportanceandthepotentialagronomicutilityoftheseloci,theyremainvirtuallyuncharacterizedinallcropspeciestodate.Here,weprovidegenetic,epigenomicandfunctionalmolecularevidencetosupportthewidespreadexistenceofgene-distal(hereafter,distal)locithatactaslong-rangetranscriptionalcis-regulatoryelements(CREs)inthemaizegenome.Suchlociareenrichedforeuchromaticfeaturesthatsuggesttheirregulatoryfunctions.ChromatinloopslinktogetherputativeCREswithgenesandrecapitulategeneticinteractions.PutativeCREsalsodisplayelevatedtranscriptionalenhanceractivities,asmeasuredbyself-transcribingactiveregulatoryregionsequencing.TheseresultsprovidefunctionalsupportforthewidespreadexistenceofCREsthatactoverlargegenomicdistancestocontrolgeneexpression.
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