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基因结构作图——超方便作图工具
[山西农业大学杂粮分子育种团队]
[李旭凯副教授开发]
基因结构作图工具AtooltodrawGenestructurebasedonperlandRlanguage.生物学知识科普:可变剪切(或选择性剪切)是一个过程,即基因或者mRNA前体转录所产生的RNA的外显子以多种方式通过RNA剪切进行重连。由此产生的不同的mRNA可能被翻译成不同的蛋白质构体,因此,一个基因可能编码多种蛋白质(图片1)。[图片1:基因的可变剪切,来源wikipedia]
[视频1:FromDNAtoprotein-3D,来源YouTube]
[视频2:RNASplicing-3D,来源YouTube]
GFF2Gene_structure.pl基于“基因组注释GFF文件”(不限物种)和基因ID,以PDF格式快速绘制基因结构,具有输入数据格式简单、输出清晰(矢量图)且易于修改(AI)、可移植性好的优点,是绘制基因结构的有用工具。
绘图要求安装perl5(