在RNA数据分析的时候,常用的思路单分子的差异性分析,寻找有差异的基因,或者基因集然后做KEGG或者GO富集分析,这容易遗漏部分差异表达不显著却有重要生物学意义的基因,忽略一些基因的生物特性、基因调控网络之间的关系等有价值的信息。
GSEA:基因集富集分析(GeneSetEnrichmentAnalysis),使用已定义的基因集,GSEA不需要指定明确的差异基因阈值,算法会根据实际数据的整体趋势,检验基因集合在两组样本中是富集还是随机分布,为研究者们提供了一种合理地解决方案。
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