科研天天有,实验总不断。随着高通量测序的开展,许多小伙伴获得数据结果却无从下手?混合26个字母与阿拉伯数字的基因名到底有何妙用?研究的基因发挥什么作用?如何检索基因并寻找数据库完成功能富集的初步分析?来当一次基因侦探,探寻ABCD基因背后的真相吧!
首先,寻找到待查基因对象的线索。检索NCBI-选项框选择Gene/Nucleotide/Protein并输入基因名缩写,如ABCD。
还真有!(ABCD基因==就是那么巧合)
然后,在Species中选Custormize可填写多个物种(人类HomoSapiens)。点击进入最匹配的英文扩展基因名内可看到该基因的基本信息。有时,单个基因可能具有很多基因名,借助蓝色提示框点击查看。
看来ABCD基因种属是牛,功能是调节牛宝宝优生优育。
紧接着锁定基因目标后,就可以使用David生物信息网站进行组学功能富集了。
针对上游的生物数据分析产生的差异基因或重要基因列表提供生物功能注释信息,DAVID系统的核心工具是ID转换,功能注释,功能分类。最大的特点是注释种类较多,而且将文件上传之后可以对文件中基因列表用各个工具进行分析。
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