油菜基因分型利器Bnapus50K甘蓝型

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导语

华中农业大学傅廷栋院士团队联合武汉双绿源创芯科技研究院有限公司成功研制Bnapus50K甘蓝型油菜基因芯片,8月15日,该项成果的论文《TheBnapus50Karray:aquickandversatilegenotypingtoolforBrassicanapusgenomicbreedingandresearch》在线发表于《G3Genes

Genomes

Genetics》。

甘蓝型油菜(Brassicanapus)是一种全球种植的经济作物,具有食用油,蜜用和青饲料等多种用途。高密度单核苷酸多态性(SNP)阵列作为有效的基因分型工具被广泛应用于油菜研究,包括基因作图、全基因组关联研究、种质资源分析和聚类分析等。

尽管大量甘蓝型油菜基因组测序数据已经发布,但DNA芯片仍然是进行油菜基因分型的有力的工具。

Bnapus50K芯片通过整合个自交甘蓝型油菜品系的重测序数据(32,,个SNPs),开发了包含42,个高质量探针的Illumina基因分型芯片。

该芯片的探针具有更均匀的遗传和物理分布,相邻探针间的平均距离为8kb。为了提高该阵列在油菜育种中的实际应用潜力,Bnapus50K芯片还添加了1,个与含油量、抗病性、雄性不育和开花期等重要农艺性状相关的功能探针及用于检测转基因材料的探针。

在测试实验中,Bnapus50K芯片探针表现出高效、灵敏的检测性能,可用于基因作图以及作物品种改良和鉴定。

总之,新型Bnapus50KDNA阵列是一种可用于甘蓝型油菜基因组育种和研究的快速通用的基因分型工具。

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