转录因子(transcriptionfactors,TFs)是直接作用于基因组，与特定DNA序列结合(TFBS/motif)，调控DNA转录过程的一类蛋白质。转录因子可以调节基因组DNA开放性、募集RNA聚合酶进行转录过程、募集辅助因子调节特定的转录阶段，调控诸多生命进程，诸如免疫反应、发育模式等。因此，分析转录因子表达及其调控活性对于解析复杂生命活动具有重要意义。图1TF功能结构示意图[1]传统的转录因子分析大多是对已知转录因子的表达和未知蛋白的转录因子预测分析，涉及活性分析的极少，而转录因子活性是其发挥作用的关键指标。因此，今天想给大家介绍的就是一款可以分析转录因子活性的软件SCENIC[2]，这款软件是基于单细胞转录组数据开发的，可以解析单个细胞中转录因子活性。对于单细胞转录组而言，转录因子活性差异不仅为细胞异质性研究带来了新的思路，同时还可以从转录因子入手快速解析关键的分析调控机制。那么话不多说，我们一起来看看这个软件到底是如何完成转录因子活性分析的吧~#1.软件简介#SCENIC是年11月发表在NatureMethods期刊的一种单细胞转录因子分析方法，也是目前进行单细胞转录因子分析的主流软件，该软件在进行数据分析的同时也能得到可视化结果图。另外，SCENIC是一款开源软件，可以免费下载使用，目前软件有R和python两个版本，每个版本都配备了详细的使用说明（软件
