文献解读Cas9介导的基因插入靶向作用肿

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▍导语

近日,匹兹堡大学医学院研究人员利用CRISPR基因编辑技术开发出一种新型的基因疗法,能够有效靶向作用促癌“融合基因”,并且改善恶性肝癌和前列腺癌小鼠模型的生存率。本周由GEMPLE捷易技术部为大家详细解读此篇文献。

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解读专栏

01研究思路:

基因组不稳定导致的基因重排与突变是肿瘤的标志特征之一,许多肿瘤都被发现含有特异的融合基因。本文作者运用Cas9nickase技术,在融合基因接口两端分别设计sgRNA识别位点,介导自杀基因HSV1-TK特异性插入肿瘤的融合基因拼接位点,而不影响不含融合基因的正常细胞,从而特异性识别并杀死含有相应融合基因的肿瘤细胞。

02实验过程:

1)EGFP-tk插入策略:作者针对融合基因两端设计Cas9切口酶识别的正/负链sgRNA与Cas9n共同包装于一腺病毒载体,同时针对融合基因接口两端设计同源臂并插入EGFP-tk(绿色荧光和自杀基因)包装于另一腺病毒载体。两种腺病毒同时感染含有相应融合基因的肿瘤细胞时,可以介导EGFP-tk基因的插入。而EGFP-tk的插入使得肿瘤细胞对Ganciclovir(更昔洛韦)敏感,从而引起肿瘤细胞死亡。(Ganciclovir:可被HSV1-TK特异性磷酸化,产物抑制DNA合成。)

Figure1SchematicofstrategytointroduceEGFP-tkintothebreakpointoftheTMEM–CCDC67fusiongene.

2)构建表达TMEM-CCDC67-fusion的单拷贝过表达稳转细胞株(PC3BP和DUBP).

作者发现用图1中的策略,感染含有sgRNA/Cas9n和打靶载体的腺病毒后,含有TMEM-CCDC67融合基因的细胞株PC3BP和DUBP有15~16%的细胞整合了EGFP-tk,而不含融合基因的对照细胞株PC3CMV和DUCMV中,EGFP-tk的整合比例只有1%。提示本策略可以较为特异的识别含有相应融合基因的肿瘤细胞。

Figure2EGFP-tkintegrationandexpressionincellsexpressingtheTMEM–CCDC67-fusionbreakpointtranscript.

3)本图提示肿瘤细胞在插入EGFP-tk后,可被Ganciclovir(更昔洛韦)诱导细胞凋亡。而未插入EGFP-tk的对照细胞,仍对Ganciclovir不敏感。

Figure3TreatmentwiththenucleotideanalogganciclovirkillscancercellsexpressingEGFP-tk.

4)本图裸鼠成瘤实验进一步证实,本策略可以抑制含有相应融合基因的移植瘤的增殖与转移,并提高裸鼠的存活率。

Figure4TreatmentwithganciclovirinducespartialremissionofxenograftedprostatecancersinSCIDmice.

5)为了验证实验的可重复性,作者在以前的RNA-Seq中发现的HUH7细胞中存在MAN2A1-FER融合基因,并针对这一融合基因设计治疗腺病毒。发现不管是在细胞水平还是在裸鼠成瘤实验中,治疗腺病毒和Ganciclovir联用都能很好的促进HUH7细胞的凋亡、抑制肿瘤增殖和转移,降低死亡率。

Figure5GenometherapytargetingattheMAN2A1–FERbreakpoint.

03实验讨论:

1、作者首次利用CRISPR/Cas9技术特异性识别并杀死肿瘤细胞,从而介导移植瘤的部分缓解。

2、但在癌症治疗的压力下可能产生额外的新突变和融合基因。

3、由于每位患者体内的融合基因可能并不一样,因此利用此策略的靶向治疗需要个体化。

以上就是文章《TargetinggenomicrearrangementsintumorcellsthroughCas9-mediatedinsertionofasuicidegene》的全部内容啦,若有疑问欢迎随时咨询!我们下期文献详解再见

稿件来源:技术部杨通博士

稿件编辑:GEMPLE捷易市场部

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