生信论文的套路
差异分析(differentialexpression);
生存分析(survialanalysis);
相关分析(correlationanalysis);
组学分析(genomicalterations);
突变分析(mutationalanalysis);
免疫分析(tumorinfiltrationanalysis)。
在科研中,我们必须弄清楚3个概念——基因、疾病和表型。疾病容易理解,分子是兴趣基因,而最难理解的就是表型。
在前期的分享中,我们分别从E2F基因家族,水通道蛋白家族等基因层面;并通过一种特殊的肿瘤——肾癌,分享基因、疾病的生信论文分析套路。在后续生信论文分享中,我们将以表型为专题,分享不同表型下的基因和疾病,以从更全面、深入的角度探究生信论文套路。
首先,我们以基因为主题进行生信论文的分享,其中E2F基因家族是典型的转录因子,与多种肿瘤的发生、侵袭等表型密切相关。
生信分析01:E2F基因与乳腺癌的生信分析
生信分析02:E2F基因与肺癌的生信分析
生信分析03:E2F基因与卵巢癌的生信分析
生信分析04:E2F基因与肝癌的生信分析
生信分析05:E2F基因与乳腺癌的生信分析
生信分析06:E2F基因与肾癌的生信分析
生信分析07:E2F基因与结肠癌的生信分析
生信分析08:E2F基因与胶质瘤的生信分析
生信分析09:E2F基因与胃癌的生信分析
生信分析10:E2F基因与胰腺癌的生信分析
随后,我们以膜蛋白——水通道蛋白为主题分享功能蛋白与肿瘤的生信论文的思路。水通道蛋白家族(aquaporins)在多种肿瘤中发挥重要的作用。
生信分析11:水通道蛋白与结直肠癌的生信分析
生信分析12:水通道蛋白与乳腺癌的生信分析
生信分析13:水通道蛋白与胃癌的生信分析
生信分析14:水通道蛋白与卵巢癌的生信分析
生信分析15:水通道蛋白与肾癌的生信分析
由于各大数据库在呈现肾癌的数据时,既有整体肾癌,又有肾癌三大亚型的数据。我们对肾癌的分型和背景做了部分整理和归纳。
生信分析16:肿瘤微环境基因与肾癌的生信分析
生信分析17:肿瘤免疫浸润与肾癌的生信分析
生信分析18:肿瘤免疫浸润与肾癌的生信分析
生信分析19:PLOD基因家族与肾癌的生信分析
生信分析20:CDK5与肾癌的生信分析
生信分析21:FBXO11与肾癌的生信分析
生信分析22:FTH1与肾癌的生信分析(推荐)
生信分析23:GPX1与肾癌的生信分析
生信分析24:CXCL13与肾癌的生信分析
生信分析25:CCL5与肾癌的生信分析
表型,英文名phenotype,译名表现型,是与基因型相对应的概念,是兴趣基因之外另一个重量级对象。疾病、基因和表型,就构成了生信分析、基础科研的基本元素。但是,最重要的还是基因和表型。
中学时,我们都学过孟德尔遗传定律,其中绿色、矮茎等是表型;描述人体特征的双眼皮、高鼻梁、宽额头、棕头发等等,也是表型。
诊断学中各种症状和体征也是表型。
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