如何预测转录因子靶基因

做完转录组分析完之后，一般会找到一些差异表达的基因。差异表达基因中如果有转录因子的话，可以研究一下转录因子调控哪些基因的表达。要预测转录因子调控的靶基因，需要两个步骤：

1.首先需要知道转录因子的结合序列特征

2.基于转录因子的结合序列特征去基因上游的promoter区搜索，如果能搜索到结合特征的序列，那么该转录因子就有可能调控该靶基因。