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随着植物表型组学的发展，越来越多的植物表型正在被挖掘和测量。丰富的植物表型数据带来了全新的角度来审视基因组和表型组之间的关系，本文通过利用基因组表型组关联分析（GPWAS）对注视的基因进行潜在功能基因的挖掘和预测，植物表型资讯如下。
通过在群体水平进行基因和表型之间的关联分析可以帮助鉴定基因的潜在功能。通常我们只对一种或几种表型进行评价。而高通量表型系统和白癜风挖掘可以对同一个体测量几十或上百的表型。作者提出在表型组学的水平与基因组中的单个注视基因进行逐个关联，并建立基因组表型组关联分析（GPWAS）的方法。
GPWAS通过利用特定群体中所有收集的表型对基因组中每个拥有SNP的基因进行逐个扫描，来检测每个基因可能相关联的表型。通过对玉米自然群体中个种质基因型和相关的个采集于多个环境中的农艺性状进行GPWAS分析。对于单个基因，在普通关联分析中不具有显著效应的表型也可能在GPWAS中被显著的基因所选择。
通过对玉米基因组水平上所有基因进行GPWAS分析，发现GPWAS所鉴定的基因富集了更多的已知控制表型的基因。这些基因在分子，群体和进化上具有与经典的玉米突变体的基因更加相近的特征。
GPWAS所鉴定的基因可能在决定植物表型中具有多效性。在用GPWAS对拟南芥中相似的数据进行分析，同样发现GPWAS所鉴定的基因也具有类似的特征。不断发展的植物表型组学领域正在催生越来越多的表型数据，而GPWAS也提供了一种全新的利用植物表型组学数据对基因组学进行分析的角度，助力植物功能基因的挖掘。
作者介绍：
梁智凯博士，本科毕业于南京农业大学农学专业，后于内布拉斯加大学林肯分校(UniversityofNebraska-Lincoln)JamesSchnable实验室攻读博士学位，并于年8月获得博士学位。现于美国明尼苏达大学(UniversityofMinnesota)NathanSpringer实验室进行博士后研究。主要从事于植物高通量表型和基因关联，植物高光谱成像与抗性育种，比较基因组等方面的研究。
来源：
LiangZ,QiuY,SchnableJC.Genome-phenomewideassociationinmaizeandArabidopsisidentifiesa
