胃肠道间质瘤(gastrointestinalstromaltumors，GIST)是胃肠道最常见的间叶组织源性肿瘤。GIST60%发生在胃，25%发生于小肠，10%发生于结直肠，极少数可发生于胆囊、阑尾、网膜及肠系膜。近年来，国内外众多对肿瘤分子发病机制的研究显示，92-95%GIST患者的干细胞因子受体(KIT)染色阳性，另有5-7%恶性GIST患者存在血小板源性生长因子受体(PDGFRA)变异，KIT和PDGFRA突变激活被认为与超过90%的恶性GIST发生发展相关。
1.KIT基因突变
GIST的KIT基因突变引起组织酪氨酸激酶受体通路的激活。GIST中KIT基因易于发生突变的区域有四个，即外显子9、11、13和17。大多数KIT基因突变(约65%)涉及近膜域(外显子11)，其次是胞外域(外显子9，约9%)，TKI，ATP结合位点(外显子13)，TKII激酶活性通路。在原发性GIST中，外显子8、12、14和18的突变较为少见。
2.PDGFRA基因突变
PDGFRA基因是一种酪氨酸激酶III型受体，与KIT相似，激活突变导致下游多细胞信号转导通路激活，控制重要的细胞功能。PDGFRA位于4号染色体，而外显子12、18和14是PDGFRA基因突变的三个区域。一般而言，近7%GIST隐藏PDGFRA基因突变，其中超过80%是外显子18错义突变。在胃和腹部间质瘤中表现出上皮型和黏液基质型，具有典型的多核和横纹肌细胞。PDGFRA基因突变(5-7%)在GIST中较为微弱。PDGFRA突变和KIT突变(80-85%)相互排斥。研究发现，约10%GIST为野生型(WT-GIST)，KIT基因外显子9、11和PDGFRA基因外显子18的突变导致WT-GIST的发生及恶化。
KIT和PDGFRA基因检测的意义
1、对于不能确诊是胃肠道间质瘤的患者，检测KIT和PDGFRA基因，若存在突变有一定的参考意义。
2、对于确诊为胃肠道间质瘤的患者，检测KIT和PDGFRA基因能够有效的提示靶向药的选择。
3、对于服用伊马替尼失败的胃肠道间质瘤的患者，若检测结果为KIT外显子9突变或野生型患者，特别是PDGFRA外显子18为DV突变类型，建议直接应用舒尼替尼二线治疗。
为了满足临床的不同需求，基因诊断中心开展了EGFR、KRAS、NRAS、BRAF、KIT、PDGFRA等单基因检测项目，检测样本为外周血，临床可根据需求灵活组合。
基因诊断中心
-（门诊）
