科学家用碱基编辑有效治疗罕见的单基因遗

单基因疾病α-1抗胰蛋白酶缺乏症(AATD)是一种影响肝脏和肺部的常见遗传病,通过常染色体遗传,临床常导致新生儿肝炎,婴幼儿和成人的肝硬化、肝癌和肺气肿等。最近一项研究结果表明,一种新的基因编辑方式可以有效地纠正AATD患者细胞中的一个突变。这种被称为碱基编辑的新方法,不同于包括CRISPR在内的其他编辑形式,因为碱基编辑不会导致DNA断裂,从而有助于防止双链断裂、潜在的脱靶编辑和细胞修复过程中不必要的突变。

这项研究是由波士顿大学和波士顿医学中心再生医学中心(CREM)的医学博士AndrewWilson和RhiannonWerder博士领导。研究者使用了患者来源的肝细胞——被称为“iHeps”,它能模仿肝脏肝细胞的生物学,肝脏细胞是身体中α-1抗胰蛋白酶蛋白的主要生产者,同样有着重要的代谢、内分泌和分泌功能。研究人员用碱基编辑技术纠正了导致AATD的Z突变,降低了疾病对肝细胞的影响,从而证明能够在人类细胞中成功进行碱基编辑。相关研究结果发表在《MolecularTherapy》杂志上,为将来的人体试验铺平了道路。

这项研究的通讯作者、波士顿医学中心的肺科医生、波士顿大学医学院副教授Wilson说:“这项研究应用碱基编辑技术,成功地纠正了AATD病患者来源的肝细胞中的致病突变。我希望这些结果将提供一条途径,利用这项技术帮助AATD和其他单基因疾病的患者。”

研究人员利用Beam-Therapeutics建立的碱基编辑器,应用于AATD患者的诱导多能干细胞(iPS细胞),然后再应用于从iPS细胞衍生的肝细胞。这样做是为了探究人类细胞中导致AATD基因“Z”突变的校正。

SERPINA1基因的Z突变,是导致AATD患者慢性进行性肺病和肝病的原因。在AATD患者中,突变的AAT蛋白发生错误折叠,形成蛋白质聚集体,在肝细胞内积聚并造成损伤。

在这项研究中,研究人员首先从AATD患者的突变型(ZZ)iPSC开始入手。碱基编辑过程完成后,对编辑细胞的DNA进行测序,以确定SERPINA1基因是否已被纠正。研究人员将含有一个(MZ)或两个(MM)校正基因拷贝的克隆细胞群进行扩增,然后在25天的过程中进行分化以产生肝细胞。在对编辑细胞的整个基因组进行测序后,没有证据表明碱基编辑的基因组中存在意外突变,MZ细胞中的错误折叠和相关蛋白堆积得到了部分纠正,MM正常细胞中的错误折叠和相关蛋白堆积得到了完全纠正。

研究人员用从突变的iPSCs衍生的肝细胞重复这个过程。在不同的条件下使用两个碱基编辑器来测试这个过程的效率。在最佳条件下,约50%的突变基因被成功编辑。然后研究人员对这些细胞进行分析,看它们是否仍然是“肝细胞”,以及与突变的ZZ细胞相比,在编辑的细胞中是否有较少的疾病迹象。结果显示,碱基编辑并没有改变肝脏程序,肝细胞仍然在正常水平表达肝脏基因和蛋白质。此外,聚集的错误折叠的“Z”AAT蛋白,其积累更少,从而表明编辑细胞中病变的证据较少。

虽然蛋白酶增补治疗已被证明能减缓AATD患者肺部疾病的进展,但目前尚无治疗AATD相关肝病的方法。新兴的治疗策略主要集中在Z突变的纠正上。

碱基编辑作为多种单基因疾病的一种治疗方式,正在进行评估。α-1抗胰蛋白酶缺乏症是碱基编辑的主要靶点,可能是人类研究中进行碱基编辑试验的早期疾病之一。其他疾病靶点包括视网膜疾病、遗传性酪氨酸血症、镰状细胞贫血、早衰、囊性纤维化等。

这项研究的结果表明,未来的研究可探索碱基编辑在编辑其他静态细胞群的有用性。此外,最近的研究表明,在永生化细胞系中,碱基编辑器除了可以编辑DNA外,还可以编辑RNA,这值得进一步研究。

Moreinformation:RhiannonB.Werderetal,AdenineBaseEditingReducesMisfoldedProteinAccumulationandToxicityinAlpha-1AntitrypsinDeficientPatientiPSC-Hepatocytes,MolecularTherapy().DOI:10./j.ymthe..06.

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