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生物隔离（biosecurity）是阻断猪源病毒进入环境的重要措施，如非洲猪瘟病毒、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒。
如何评价生物隔离的效能？
第一种方法是通过非洲猪瘟病毒核酸检测。通过非洲猪瘟病毒来监测环境污染程度往往会挂一漏万，尤其是对于非洲猪瘟阴性的环境监测更是无效。
第二种方法是通过在环境中释放猪用疫苗，然后通过检测目标核酸来考核环境清理的情况。然而，这样的人工释放往往会浮于表面，对于隐藏在有机物内部的野毒却无从评价。
第三种方法是直接检测猪源基因。通过检测猪源基因基本可以涵盖有机物干扰的真实场景，做到万无一失。只有猪源基因消失了，环境才真正干净了。生物隔离才真正功成圆满，才可以考虑进猪饲养。
猪栏及出猪台清洗消毒、车辆清洗消毒、返场人员检查、进场物资管理、仔猪转栏、新猪入场，均可以通过猪源基因监测进行效果评估。
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