专家点评Cell破除转录桎梏EJ

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徐萌(清华大学)、王皞鹏(上海科技大学)撰文

宝叔责编

兮效应T细胞是对抗感染和肿瘤的核心细胞亚型。因此,如何在慢性感染或者肿瘤发生中增强效应T细胞响应,是T细胞相关免疫疗法的关键所在。免疫检查点抑制剂,诸如PD-阻断剂等,可以有效的将慢性感染或者肿瘤微环境中的耗竭性T细胞重新激活,使之具有部分效应T细胞特征。然而,由于慢性感染或者肿瘤环境会筛选性的促进效应T细胞死亡,介导耗竭性T细胞分化,同时若慢性炎症环境未清除,免疫检查点抑制剂引起的效应T细胞再激活并不具有持久性,因此如何在慢性感染或者肿瘤进展过程中,增强稳定的效应T细胞响应,成为T细胞相关疗法中的一个主要问题。近期的研究发现多个转录因子,包括c-Jun,Runx3等,可以帮助T细胞在肿瘤微环境中更好的发挥效应功能。另一方面,敲除特定转录因子,诸如TOX和NR4A,会介导短期内较强的效应T细胞响应。然而,在转录层面上,领域内仍旧缺失一个如PD-的,具有高强度抑制效应T细胞扩增或者分化的“刹车机制”。年2月25日,宾夕法尼亚大学的E.JohnWherry和史俊炜团队(第一作者为陈则宇博士)于Cell上发表了题为“InvivoCD8+TcellCRISPRscreeningrevealscontrolbyFliininfectionandcancer”的文章,采用优化的T细胞CRISPR体内筛选体系,鉴定出了转录因子Fli对于效应T细胞扩增和分化的强烈抑制作用。在不同的体系中,敲除Fli的抗原特异性CD8T细胞会获得5-30倍的数量扩增,并且获得更强杀伤性淋巴细胞特征。研究人员首先建立并且优化了针对抗原特异性T细胞的体内CRISPR筛选体系(命名为“OpTICS”),包括更改了逆转录病毒载体的sgRNA序列,使用单Cas9拷贝的载体细胞进而降低DNA损伤对效应T细胞的影响,优化了转染和细胞分选方案等。之后,研究人员结合已有的抗原特异性T细胞在不同阶段的RNA-Seq和ATAC-Seq数据,根据基因表达量筛选出来了20个转录因子,建立了转录因子sgRNA文库。利用OpTICS系统,研究人员鉴定出了在急性和慢性感染模型中,具有阳性筛选特性的多个转录因子,包括Fli,Smad2,Erg,Nfatc2,Irf2等等。之后研究人员重点


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