近期有一个比较共性的问题，那就是很多童鞋也拿到了目标基因或者是候选基因，但是拿捏不准该如何向下去研究它，针对这个情况，我们大概整理了一些常见思路供大家参考。
1、基因的亚细胞定位和时空(发育期或梯度处理，不同组织/器官)表达谱；
2、基因在转录水平的调控(可以通过genomewalkingPCR或通过已有的资源库寻找该基因的启动子等转录调控区域，通过单杂交或ChIP等技术，寻找该基因的转录调控蛋白)；
3、细胞生化水平的功能研究(也就是蛋白蛋白作用复合体的寻找验证，具体方法有酵母双杂交，GSTpulldown，co-IP，BRET，FRET，BiFc等，对该基因的表达产物做一个细胞信号转导通路的定位)；
4、gain-of-functionloss-of-function：也就是分别在细胞和个体水平，做该基因的超表达和knockdown(或knockout)，从表型分析该基因的功能；
5、也可尝试从完整的分子-细胞-个体三个层次研究，综合分析，关于基因的表达和定位，可以这样去做：
a、mRNA水平检测基因表达：选择表达目的基因的组织/细胞(发育不同时期、机体不同部位、加处理因素...)，提取RNA，反转录，做RT-PCR，检测基因的表达情况/变化。(或者以northernblot、Rnaseprotectionassay方法，检测基因的mRNA表达情况/变化)
b、蛋白质水平检测基因表达：选择相应的组织/细胞，以Westernblot、免疫组化(OR免疫荧光)检测目的蛋白的表达。
c、检测目的蛋白的细胞定位：将目的基因克隆至带荧光标签(如GFP)的表达载体，在适合的模式细胞中表达，在活细胞中观察蛋白的细胞定位。
大概就分享这么多吧，仅作参考，希望能对科研有所帮助
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