立克次氏体：是一类专性寄生在真核细胞内的革兰氏阴性G-原核生物。
麦角甾醇：又称"麦角固醇"，是甾类化合物之一。真菌细胞膜的重要组成部分。
密码子：指mRNA上编码指定氨基酸的相邻三个碱基序列
氧化磷酸化：又称为电子传递链磷酸化，指呼吸链的递氢和受氢过程与磷酸化反应相偶联并产生ATP的作用。
饰变:即外表的修饰性改变，指不涉及遗传物质的变化只发生在转录和翻译等水平的表型变化。
双重溶原菌：λdgal（带有供体菌gal基因的λ缺陷噬菌体）与λ可同时整合在一个受体菌的核染色体组上，这种同时感染有正常噬菌体和缺陷噬菌体的受体菌就称双重溶原菌。
VA菌根：泡囊-丛枝状菌根又指丛枝状菌根或丛枝菌根，因为少数丛枝菌根的菌丝末端膨大，形成泡囊。
反硝化作用：在无氧条件下，某些兼性厌氧微生物利用硝酸盐作为呼吸链的最终氢受体，并把它还原为亚硝酸盐、NO、N2O直至N的过程，又称异化硝酸盐还原作用。
干扰素：指一类具有高度种属特异性的糖蛋白，具有抗病毒，抑制细胞增殖等作用。
微生物生态学：研究微生物群体(微生物区系或正常菌群)与其周围的生物和非生物环境之间相互关系的一门科学。
贫营养细菌：贫营养细菌又称寡营养细菌，是指生活在有机物含量比较低的水体或土壤中的一部分细菌，它们多数是化能自养微生物和光能自养微生物为主，如硫细菌、铁细菌等.
根际微生物:是指紧密附着于根际土壤颗粒中的微生物，以细菌为主，其中革兰氏阴性菌占优势。
发光细菌:是一类G-，长有极生鞭毛的杆菌或弧菌，兼性厌氧，在有氧的条件下能够发出-nm的荧光。
活性污泥:指一种由活细菌、原生动物和其他微生物群聚在一起组成的凝絮团，在污水处理中具有很强的吸附、分解有机物或毒物的能力。
Abuscularmycorrihza:丛枝菌根：是菌根的一种，其中丛植真菌穿透维管植物根部的皮质细胞。
Bacteroids：（拟杆菌）：细菌的一种。革兰氏染色阴性，无芽孢，化能有机营养的专性厌氧杆菌。
Heterotrophs:异养型：指必须利用有机碳源的微生物（为数众多）。
衍生概念：光合自养型（phototrophs）;化能自养型（chemolithotrophs）
Auxoautotrophs：自养型：指能够使用光能或者无机碳源合成自身生长发育所需要的有机物的生物。
Conidium：分生孢子：一些真菌在进行无性繁殖时，在菌丝分枝顶端的产孢细胞（或分生孢子梗）上分割或缢缩而形成的单个或成串的孢子。
腐生菌：（Saprophyticbacteria）：营腐生生活的一类细菌，它们从已死亡的植物、动物或其它有机物中吸收养料以维持自生的生长和生命活动。
纤维素分解菌：（cellulose-de
