从经典文献学习临床科研设计进行性肌

编译:MarkXie,张彩丽

编者按:

NatureGenetics杂志(IF27.12)于年发表了”ArecurrentdenovomutationinKCNC1causesprogressivemyoclonusepilepsy”一文,由芬兰福克萨遗传学研究所完成,研究报道了KCNC1的复发性新生突变导致了进行性肌阵挛性癫痫。

这是一篇可以作为模板的利用散发样本完成的致病基因研究。

中国的最大特点是,罕见病特别集中于少数几个中心。所以做成类似研究、甚至更好也就更有优势。

Mark

研究背景

进行性肌阵挛性癫痫(PME)是一组罕见的遗传性疾病,是最具破坏性的癫痫形式之一。

PME具有临床和遗传异质性,其特征是运动性肌阵挛,强直-阵挛性发作和进行性神经衰退。大多数PME以常染色体隐性方式遗传,少数病例显示常染色体显性遗传或线粒体遗传。

由于该疾病遗传异质性较强、症状与其他类型癫痫病部分重叠导致表型相近,故对于该病的精确临床分子诊断尚存一些难点。

找到致病基因、及明确不同临床表型与基因型的关系,是本研究的目的。

研究方法

样本:

发现队列:对84例不相关的PME病例进行外显子组测序,其中70例为散发性病例,14例来自家系暗示显性遗传或隐性遗传的家族。

验证队列:28例散发样本进行Sanger测序验证点突变。

研究方法:

外显子组测序,平均测序深度81x

测序数据和人参考基因组的比对,进行变异检测,注释并过滤出有害的突变位点,以常显、常隐、伴性遗传、线粒体遗传模式分别进行筛选。


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