Cell综述利用CRISPR基因编

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北京时间12月17日,Cell在线发表了华盛顿大学题为“ACrisp(r)NewPerspectiveonSARS-CoV-2Biology“的综述文章。转眼间,年就快要过去了,新冠疫情也发生了快一年,但是疫情情况在全球依然险峻,这一年中,全球科学家们也在对新冠病毒的深入了解进行了各方面不断的努力。近日,Adam等人就对这一年中利用CRISPR技术对新冠病毒的生物学进行解析的进展进行了总结。CRISPR-Cas9技术在生命科学领域已经得到了广泛的应用。单引导RNA(sgRNA,)是由一小段自主设计的crRNA序列与tracrRNA序列支架融合得到的一个单个RNA分子。基于sgRNA库的CRISPR-Cas9筛选系统可以帮助我们了解到基因的功能和基因表达对细胞的作用。科学家们就基于全基因组CRISPR-Cas9筛选这种方法得到SARS-CoV-2的生物学的大量信息。本文对从SARS-CoV-2接触细胞,到离开感染细胞这个过程的一些宿主因子进行阐述。从SARS-CoV-2附着于细胞表面开始,除了之前发现的蛋白受体ACE2,还筛选到了跟糖胺聚糖(GAGs)有关的基因。GAGs是带负电荷的多糖,其位于细胞表面可能通过将通常含有正电荷斑块的病毒吸引和浓缩到细胞表面上来增强感染性。然后SARS-CoV-2通过两种方式进入细胞,一种是被组织蛋白酶L切割和激活刺突蛋白,被细胞内吞进入细胞,另外一种是被一种位于质膜上的丝氨酸蛋白酶TMPRSS2激活刺突,绕过内吞途径,直接融合进入细胞。在SARS-CoV-2进行翻译时,鉴定到了一种内质网宿主因子TMEM41B蛋白,TMEM41B将内质网膜塑造成有利于病毒复制工厂形成的结构。最后也鉴定到了几个帮助SARS-CoV-2离开细胞的宿主因子,如磷脂酰肌醇激酶(PIK3C3,PICfyve)和TMEMB通过胞吐作用让病毒离开感染细胞。这些论文中确定的基因需要进一步研究,以全面了解SARS-CoV-2生命周期,其中筛选鉴定的许多基因和复合物有望成为的抗COVID-19治疗的靶标。而且其中一些基因除了对SARS-CoV-2外,还对多种不同冠状病毒都有相应作用。所以基于全基因组CRISPR-Cas9筛选的这种方法可以确定病毒生物学的共同方面,从而能够开发广泛作用的抗病毒药物,这可以帮助我们为下一次病毒大流行做好准备。也希望全球都能在不久的将来走出新冠疫情!

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