基因检测是什么如何指导靶向治疗

在前面的文章中,我们知道了基因是什么:基因和人的生老病死都紧密相关。我们明白了癌症和肿瘤的关系:癌症=恶性肿瘤+血癌。肿瘤=良性肿瘤+恶性肿瘤我们也知道了癌症就是基因病。明白癌症就是基因病,也知道了基于基因突变为靶点的治疗是靶向治疗。

基因是什么?

肿瘤就是癌症吗?NO!NO!NO!

基因和癌症的关系?

什么是靶向治疗?

靶向治疗耐药了怎么办?——一文告诉你靶向药发展史

肿瘤靶向治疗耐药后怎么办、靶向药的发展史等都清楚了。然而在这其中起关键角色的基因检测到底是什么?又要怎么做呢?生命科学是复杂而又有意思的,没有受到生物学训练的人看相关的内容可能比较枯燥无味,这里我们尽量用简单易懂的语言组织,为您展现前沿的基因与肿瘤相关知识。

基因检测基因检测,顾名思义就是对基因的突变、mRNA的表达(前文中的中心法则展示DNA转录组成mRNA)、基因的扩增(比如HER2扩增等)、基因的甲基化(一种不改变基因序列的突变,对某个位点进行修饰)等通过各种技术方式进行检测。我们主要针对基因检测和靶向治疗及靶向治疗耐药监测的关系。

首先,我们必须搞清楚两个概念:“胚系突变”、“体系突变(也叫体细胞突变)”

其实很简单,胚系突变就是来源于父母双亲的与生俱来的突变,人体所有的细胞都一样有这个突变;而体系突变则是人体的某个部分发生的突变,比如肿瘤细胞发生的其他正常细胞没有的突变(肺癌的EGFR)。

从之前的文章中我们了解到,靶向治疗之前必须做基因检测来确定有哪些基因突变,从而来决定应该使用什么靶向药(EGFR抑制剂、ALK抑制剂等),同时一旦靶向药耐药的话要监测什么时候出现耐药基因突变(EGFR基因的TM突变)。这里的基因突变指的就是“体系突变”。只发生在癌细胞里面的突变,这样靶向药就能精准的去杀灭这些癌细胞。

所以呢,以前基因检测所需要的样本就是肿瘤的组织(穿刺、手术切下来做成的病理切片、石蜡块、有癌细胞的胸腹水等),现在随着科研、科学技术的发展和交叉,已经可以通过血液来进行“体系突变”(体细胞突变)的基因检测了,这个就是所谓的液态活检。

年以前普遍的共识是:胎儿的细胞或者DNA是不能透过胎盘屏障进入孕妇身体内!但97年香港的一位科学家发现,在孕妇的血液里面发现了男性特有的Y染色体上面的基因SRY,那这个SRY是哪里来的呢,只能是来自于胎儿。可以通过检测这个游离的DNA来判断胎儿的基因是否正常。这比传统的危险的羊水穿刺方法好多了,无创。所以最开始基于血液的基因检测主要是胎儿性别鉴定、唐氏综合症筛查的。这个时候就有人会想,既然胎儿的DNA能够通过胎盘屏障,那么肿瘤细胞里面的DNA会不会进入血液循环呢?确实会!人们在血液里面发现活性的肿瘤细胞——称为循环肿瘤细胞(CTC)、也发现了来自于肿瘤细胞微量的DNA——称为循环肿瘤DNA(ctDNA)。只是限于当时的技术,极其微量的DNA是没有一个好的方法来进行方便的检测,直到近十年,高通量测序迅猛发展,精度越来越高,成本越来越低,正好和血液的液态活检充分结合起来了。

液态活检

液态活检相对组织活检有相当多的优点,比如无创——不需要穿刺获取组织;全面——肿瘤组织有很强的异质性,穿刺等方法取到的组织不能代表整个肿瘤组织,还有其他诸于实时、可多次取样等优势。任何事物都有两面性,液态活检也不是完美,其缺点是早期癌症比组织稍差。

现在临床上有非常多的检测方法。基于液态活检主要是高通量测序和dPCR(这个基于PCR的方法一次只能检测比较少的位点,成本也较高)。基于组织的有qPCR、IHC、FISH等方法。这些方法大多有一些无法回避的问题,比如通量低、灵敏度低、要求的起始量高(也就是必须是组织,无法做血液,从而继承了组织相对血液的异质性、有创等问题)。

很庆幸现在有了这么多的基因检测方式,特别是基于高通量测序的无创的液态活检技术,方便操作同时成本也下降到合适的范围。我们临床上有了更方便的方式来进行基因检测,来更好的发挥靶向治疗的功力。

基因检测还可以指导对化疗药的用药,这个检测的就是前面所说的“胚系突变”了我们可以在后续的文章中进一步给您介绍这方面的知识,敬请







































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