在上一期的培训中,我们给大家介绍了5mCDNA甲基化的形成机制和高通量检测方法。在这一期的课程中,我们就要真真正正地介绍5mC甲基化在生物体内是如何起到调控作用了。
尽管DNA甲基化是一种普遍存在,是发现最早的DNA修饰机制。大家对其功能多少都有所耳闻,例如,启动子区的DNA甲基化通常会抑制基因转录。但DNA甲基化的功能又不是如此简单,大家对其功能的了解多多少少是片面的。
例如,DNA甲基化一般不是直接抑制基因转录,而是强化已有的转录抑制。DNA甲基化一般不会单独起作用,而是总是伴随组蛋白修饰的变化,共同调控染色体的结构。发生在编码区的DNA甲基化,并不一定会抑制基因表达,而是可能会促进转录本的延伸或调控可变剪切。
图1DNA甲基化与其他组学的互作
以上这些DNA甲基化的功能,本质上都离不开其与他组学(组蛋白、小RNA、转录组)的互作。因为DNA甲基化参与机体调控的多样性,我们甚至可以认为DNA甲基化是中心法则其外的另外一个中心(图1)。本期OmicShare在线课堂,我们将从以下两个方面开展讲解:
1.DNA甲基化与其他组学互作的生物学机理
a)DNA甲基化与组蛋白(H3K4me3、H3K27me3等)的互作;
b)DNA甲基化对转录的调控作用;
c)DNA甲基化与小RNA的互作。
2.DNA甲基化与多组学贯穿分析
a)常见分析思路;
b)图形呈现方法。
第32期OmicShare课堂交流主题:
DNA甲基化与多组学贯穿分析
交流时间:
5月4日(下周四)下午16:00
交流嘉宾:
周老师