年伯豪生物成立转化医学服务中心,以基因组大数据及重大疾病研究中心为依托,全面服务临床医生从科研到临床检测到产品转化的转化医学之路。
今天我们一起来回顾一下伯豪生物转化医学服务平台最经典的案例之一:科学家们利用AgilentmicroRNA芯片筛选、RT-PCR验证等方法寻找到7个microRNA的组合,这一组合能对乙型肝癌(hepatitisBvirusrelatedHCC)患者进行早期诊断。相关成果发表在肿瘤学顶级期刊《JournalofClinicalOncology》上。microRNA生物芯片技术服务及数据分析服务由上海伯豪生物技术有限公司提供。
日前该团队研发的“7种微小核糖核酸肝癌检测试剂盒”已成功转化为普适于临床的体外诊断产品并生产上市。
肝癌(hepatocellularCarcinoma,HCC)是死亡率仅次于胃癌、食道癌的世界第三大常见恶性肿瘤。目前常用的肝癌诊断方法有影像学和生物标志物法,但是这些诊断方法的灵敏性和准确率都不够,以至于只有约30%的肝癌能被早期诊断出来。寻找灵敏高效的肝癌早期诊断方法对于肝癌的治疗有重大意义。
microRNA在年首次被发现。许多研究表明,在肝癌和癌旁正常组织之间存在microRNA表达谱的差异。另外,研究发现在人类血清血浆中存在大量稳定的microRNA。这些现象表明,大家可以寻找肝癌患者血清血浆中高含量的microRNA,以此作为生物标志物进行肝癌的早期诊断。在本文中,科学家们利用AgilentmicroRNA芯片筛选、RT-PCR验证等方法寻找到7个microRNA的组合,这一组合能对乙型肝癌(hepatitisBvirusrelatedHCC)患者进行早期诊断。相关成果发表在年11月的《JournalofClinicalOncology》上。microRNA生物芯片技术服务由上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心完成。
科学家们首先使用microRNA芯片对比肝癌患者VS正常人群,肝癌患者VS慢性乙型肝炎(chronichepatitisB,CHB)患者,肝癌患者VS肝硬化(cirrhosis)患者血清血浆microRNA的表达谱。结果筛选出15个明显差异表达的microRNA。
microRNA芯片聚类结果
随后科学家们利用RT-PCR的方法对这15个microRNA进行验证分析,从中筛选出7个确定差异表达的microRNA。并利用份样品的RT-PCR数据建立起了一个多指标的logisc回归分析模型,用以区分肝癌患者和其它对照人群。最后科学家们又利用份样品对建立好的诊断模型进行验证。该模型区分肝癌患者和正常人群的正确率能达到94.1%。这项研究成果对于肝癌的早期诊断和治疗有重大意义。
Receiveropera/ngcharacteris/c(ROC)
曲线分析肝癌患者与正常人群之间该组microRNA的表达差异,AUC值为0.
课题思路
原文出处:
ZhouJ,YuL,GaoX,HuJ,WangJP,DaiZ,WangJF,ZhangZY,LuSH,HuangXW,WangZ,QiuSJ,WangXY,YangGH,SunHC,TangZY,WuY,ZhuHG,FanJ.PlasmaMicroRNAPaneltoDiagnoseHepatitisBVirus–RelatedHepatocellularCarcinoma.JClinOncol.
使用服务种类:AgilentmiRNA芯片服务
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