Fusionsinsolidtumours:diagnosticstrategies,targetedtherapy,andacquiredresistance
AlisonM.Schram,etal.Naturereviewsclinicaloncology.31Aug
01图1
描绘各种恶性肿瘤中选择的致癌融合基因的发现时间和用于检测它们的方法。结构重排及其后的基因融合首先在慢性骨髓性白血病患者中被发现，其中含有t（9;22）（q34;q11）易位的肿瘤细胞容易从血液中获得并用于细胞遗传学分析。随后在肉瘤（如t（11;22）（q24;q12）和t（17;22）（q22;q13））和癌组织中使用类似技术发现染色体间基因交换，导致易位。
用于检测基因融合的技术随着时间的推移而演变，包括多种检测平台方法，包括荧光原位杂交（FISH）和逆转录酶PCR（RT-PCR）分析，能够检测产生融合物的染色体内事件（例如，那些导致EML4-ALK和KIF5B-RET融合的事件）。目前，采用无偏差的融合检测技术，如NGS测序和anchored-multiplexPCR，可以在研究和临床中检测到越来越多的融合事件。DFSP，皮肤纤维肉瘤。
激酶融合在原发肿瘤部位的分布。融合基因的重排(能够被靶向治疗药物所抑制）被认为是具有临床重要意义的驱动基因事件。图中显示了所选择的临床相关基因融合的分布，特别是涉及ALK，ROS1，RET，NTRK1/2/3，FGFR1/2/3和BRAF/CRAF在不同器官起源肿瘤的分布。这些融合的频率在不同肿瘤之间变化很大，从孤立病例报告到在大样本报道的融合事件。在恶性肿瘤中临床相关基因融合的广泛存在支持，提示有必要用basket方法（masterprotocal）来设计涉及靶向治疗的临床试验。
临床中用于检测基因融合的方法
尽管针对基因融合变异的肿瘤已经有多个靶向药物获批，目前被FDA批准作为“伴随诊断”的诊断方法，仅限于对ALK，ROS1，BRAF的融合进行诊断；其中包括用于ALK检测的FISH，VentanaIHC，以及用于RSO1，BRAF诊断的NGS（On
