基迪奥客户合作文章翻译组测序揭示经典

图环状RNA的潜在功能

前言

环状RNA的功能自从0年高等动物体内被发现和报道后,其功能的研究就一直是热点。环状RNA功能与亚细胞定位相关。

()细胞核:可以参与转录调控,例如EIciRNA。

()细胞质:miRNASponge作用以及对应产生的ceRNA效应,是最常见的研究套路。

环状RNA的miRNAsponge作用,其风向标来自于最早的两篇Nature文章[,3]。这两篇文章都报道环状RNACDRas对miRNAmiR-7的sponge作用,从而引发了环状RNA的miRNAsponge研究的热潮。但实际上,环状RNA的sponge作用可能被高估了。

因为CDRas是环状RNA中极其罕见的特例:

a)CDRas表达丰度非常高(在所有环状RNA中排第一),高到甚至与内参基因相当。

b)CDRas上有高达73个miR-7的结合位点,这在环状RNA中也是非常罕见的特例。

对于绝大部分环状RNA表达丰度非常低,且不一定包含如此高密度的miRNA结合位点,所以大部分环状RNA其对miRNA吸附能力是有限的。因此如果对丰度不高的环状RNA开展sponge研究,在细胞或动物水平的效应可能不会十分显著。

随着07年的第一篇报道环状RNA被发现可翻译[3],环状RNA翻译为环状RNA的功能研究提供了新的方向。从逻辑上说,多肽属于微量就可以起到巨大效应的分子,所以对于较低丰度的环状RNA更有可能通过翻译多肽来起到生物学作用。

医院的张弩教授(基迪奥合作客户)在之前的系列研究中,分别报道了蛋白编码基因(FBXW7和SHPRH)在形成环状RNA后形成新的功能多肽,且具有肿瘤抑制功能[4,5]。从谷歌学术的引用率来看,就知道这个新领域正在受大量


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