每次准备专心写稿子时
这个世界就忽然变得非常有趣
任何一点风吹草动
都能轻易的吸引我
----------进入正题----------
即使不是专门做基因组学
或者生物信息学的科研狗
也经常会拿到一批基因
比如公司帮忙做的表达谱芯片
筛选出的差异基因
公司通常会帮忙做基因富集分析
但结果一般都隐隐透着一股商业化气息
总觉得不那么接底气
此外
基因富集分析的需求场景
越来越多
这项技能
似乎不再是生信人员的专长
而是行走科研江湖的必备
Emm…
下面简单介绍一点富集分析里的
GO(功能聚类)分析
…
最近我做GO分析的一套常用操作如下
DAVID
↓
Gorilla
↓
ENRICHR
↓
GREAT(如果是chipseq数据)
↓
Clusterprofiler
↓
Genescf
这个流程的前四个软件
都是在线可用
最后两个需要R和perl加持
今天主要谈下前面三个的用法
(最基本用法,够用)
DAVID
如果知道GO是什么的话
那一般都了解DAVID
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