基因富集分析的一顿靠谱操作GO篇

每次准备专心写稿子时

这个世界就忽然变得非常有趣

任何一点风吹草动

都能轻易的吸引我

----------进入正题----------

即使不是专门做基因组学

或者生物信息学的科研狗

也经常会拿到一批基因

比如公司帮忙做的表达谱芯片

筛选出的差异基因

公司通常会帮忙做基因富集分析

但结果一般都隐隐透着一股商业化气息

总觉得不那么接底气

此外

基因富集分析的需求场景

越来越多

这项技能

似乎不再是生信人员的专长

而是行走科研江湖的必备

Emm…

下面简单介绍一点富集分析里的

GO(功能聚类)分析

最近我做GO分析的一套常用操作如下

DAVID

Gorilla

ENRICHR

GREAT(如果是chipseq数据)

Clusterprofiler

Genescf

这个流程的前四个软件

都是在线可用

最后两个需要R和perl加持

今天主要谈下前面三个的用法

(最基本用法,够用)

DAVID

如果知道GO是什么的话

那一般都了解DAVID

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