摘要:
1.重要性:在已经建立的具有中度或高度渗透风险基因发生中发生的乳腺癌(BC)和/或卵巢癌(OC)细胞突变,包括BRCA1和BRCA2,解释了少于一半的乳腺癌(BC)和/或卵巢癌(OC)的病例。在2个功能丧失的(LoF)变体c.cT(p.GInTer[rs])和c.cT(p.ArgTer[rs])基因分型的基础上,FANCM基因被建议作为一种新型的的BC易感性基因,但是在整个家族指数情况下分析整个FANCM基因的编码区和地理对照悬而未决。
2.目的:评估FANCM基因内的突变谱,并确定FANCM基因内的LoF种系突变与BC和/或OC风险的潜在关联。
3.设计、设置:为了识别和描述异常的BC和OC的易感性基因,通过下一代测序,为了(检查)FANCM基因中的LoF基因突变,对总计个具有良好家族指数BC的个体,个具有良好家族指数OC的个体以及个地理对照组进行了筛查。所有患者先前测试为阴性病原BRCA1和BRCA2突变。
4.主要结果和措施:通过单因素Logistic回归分析,将BC和/或OC患者的FANCMLOF突变频率与地理上相匹配的对照组的FANCMLOF突变频率进行了对比。发病年龄和家族史呈正相关。
5.结果:在这个病例对照研究中,为了进行截断FANCM改变,对个具有良好家族指数BC指数的个体,个具有良好家族指数OC指数的个体以及个地理对照组进行了筛查,与整体值2.05相比和在1.03%指数的情况下,FANCM基因内杂合型突变与家族性BC风险显著相关。51岁以下发病的BC家族性患者,可观测到OR升高了2.44.(95%CI,1.08-5.59;P=0.02)。对于三阴性乳腺肿瘤表型(OR,3.75;95%CI,1.00-12.85;P=0.02)的患者确立了更明显的联系。在未选中的OC的案例中,没有发现显着相关(OR,1.74;95%CI,0.57-5.08;P=0.27)。
6.结论和参考:基于杂合性LoF突变与早发性或三阴性BC的显着关联,FANCM检测应包括在用于个体风险评估的诊断基因Panel中。需要更大的研究来确定BC的年龄依赖性疾病风险并评估FANCM突变在OC发病机制中的潜在作用。
几个Fanconi贫血补体基因中的单等位基因突变,包括FANCD1/BRCA2,FANCJ/BRIP1,FANCO/RAD51C和FANCN/PALB2,导致乳腺癌(BC)和/或卵巢癌(OC)的中度至高度风险,而在BC和/或OC发病机制中其它Fanconi贫血相关基因的作用仍然难以捉摸。在这些基因中,FANCM(OMIM)是一种合理的候选物,因为FANCM蛋白及其结合配偶体FAAP24(OMIM)基本上需要在DNA损伤后将多亚基Fanconi贫血核心复合物锚定在染色质上。FANCM基因内的种系变体,c.CT(p.GInTer[rs])和c.CT(p.ArgTer[rs])与增加的BC风险相关。
在芬兰人口的研究显示无义变体c.CT与家族性BC相关。在女性对照个体中载波频率(CF)为1.83%,该突变似乎在芬兰人中特别频繁。总体而言,在3.39%的BRCA1(OMIM)和BRCA2(OMIM)阴性家族性BC病例中发现c.CT突变,在具有三阴性(TN)BC肿瘤表型的主要未选择的病例的亚组中观察到甚至更高的CF为5.88%。在例未选择的OC病例中未建立显着相关性。一项多国研究调查c.CT,显示与BC相关的第二个变异体在个BRCA1和BRCA2阴性家族性BC病例和个对照个体中证实了截断FANCM突变和BC风险之间的关联,CF在病例中为0.21%,在对照中为0.06%OR为3.93。c.CT变体已经显示产生外显子剪接沉默子,导致不完全的外显子22跳跃和蛋白截短(p.GlyAlafs12Ter)。因此,c.CT无义变体仅在转录物水平上几乎检测不到。
因为迄今为止描述的所有研究仅依赖于2个截短的种系变体,所以对患者和地理匹配对照中的FANCM基因的整个编码区的突变分析正在进行中。此外,已知携带截短FANCM突变的患者的更高累积数量需要建立基因型-表型相关性,特别是关于TNBC肿瘤表型和癌症部位。
结果
总体而言,个指数病例中的21个携带杂合截短FANCM突变,导致与来自德国对照的的全外显子组测序数据相比,累积CF为1.03%(OR,2.05;95%CI,0.94-4.54;P=0.)(表)。在名患者中共有名(76%)受BC的影响,并且没有报道OC的个人或家族史。在名患者中,我们在16名患者中鉴定了截断突变,导致累积突变频率为1.03%。在BC的剩余例患者中,有个人的OC史,5名(1.00%)携带截断的FANCM突变。除了诊断为BC和OC的62个家族性指数病例之外,我们随后分析了个未选择用于家族史的BRCA1和BRCA2阴性OC病例。与Kiiski等报道的数据相比,在相对于对照(OR,1.74;95%CI,0.57-5.08;P=.27)的OC病例中观察到0.%的略微增加的累积CF,未达到统计学显著性。总之,对FANCM基因的整个编码序列的第一次研究揭示了与家族性BC相关的弱但显着的总体相关性。
当我们对发病年龄(AAO)的个家族性BC指数病例进行分层时,
例(68%)病例在51年前有AAO。在该亚组(平均AAO,41岁)中,鉴定出17个突变携带者,导致1.22%的累积CF(OR,2.44;95%CI,1.08-5.59;P=0.02)。在AAO为51岁或以上(平均AAO,59岁)的BC患者中,累积CF为0.%,这与在对照中观察到的相似。基于个主要未选择的TNBC病例的基因分型,Kiiski等报道了芬兰人群中FANCM无义变体c.CT与TNBC肿瘤表型之间的显着关联(OR,3.56;95%CI,1.81-6.98;P.)。在例家族性BC指数病例中,在例(10.50%)病例中报道了TNBC肿瘤表型,其中4例携带杂合性FANCM突变(CF,1.86%;OR,3.75;CI,1.00-12.85;P=0.02)。因此,我们的结果证实FANCM基因内的杂合LoF突变与TNBC肿瘤表型的关联,并在家族性指数病例中建立与早期BC疾病的关联。总之,我们确定了21名携带FANCM基因中携带杂合LoF突变的BC指数患者。在21个突变携带者的队列中,我们观察到BC的平均AAO为46岁(年龄范围,32-65岁)。一种突变携带者也在62岁时发展为浆液性OC。大多数BC病例没有特殊类型,分类为2级。通过在2个家族中的分离分析鉴定了三个另外的受影响的突变携带者。
Table.FANCM基因内杂合功能失调的胚系突变频率
讨论
筛选FANCM基因的整个编码序列揭示其与家族性BC的弱但总体显着的关联。该研究在家族性指数病例中建立了FANCM与早发性BC疾病之间的关联。此外,它证实了FANCM基因内的杂合LoF突变与TNBC肿瘤表型的关联。然而,本研究集中在家族性病例,这可能导致在确定突变频率的显着选择偏差。对于其他中度渗透性风险基因,如CHEK2,已经证明ORs在家族中比在未选择的BC病例中更高。因此,可能值得分析未选择的BC病例,然后对早发性BC或TNBC进行分层。此外,将需要在更大的样品组中的另外的研究以建立FANCM突变在OC发病机理中的潜在作用。然而,基于目前的分析和以前发表的研究结果,建议将FANCM突变放入诊断性基因panel检测中。
文献来源:AssociationBetweenLoss-of-FunctionMutationsWithintheFANCMGeneandEarly-OnsetFamilialBreastCancer.JAMAOncol.PublishedonlineDecember29,.doi:10.1/jamaoncol..
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