基因检测完全替代常规体检国外给出了严谨

近日,JAMAPediatrics杂志发表了一篇文章(PMID:),研究了全外显子基因测序(WES)对疑似单基因病流动患儿的诊断价值和经济效益。课题组前期的一项试验,研究对象主要是小于2岁且怀疑有一种单基因病的婴幼儿,发现WES的阳性率57%,而常规辅助检查的诊断率仅为13.5%。在该研究中,课题组又对大年龄患儿进行了调查。

研究对象:

研究对象是2-18岁疑诊单基因病的流动儿童,纳入的患儿均是经过遗传学评估仍未临床确诊的典型病例,排除了通过临床评估即能确诊的病例,如软骨发育不全或1型神经纤维瘤病。

课题组只评估了与表型相关基因突变的致病性,最后对先证者及其父母进行Sanger测序验证。对疑诊病例的WES数据进行复查,以确定新发现的基因突变是引起患儿相关表型的原因。

成本计算:

课题组收集了从起病到三级诊疗、首次临床遗传学评估、登记和WES报告的所有资料。所有住院和门诊病人的诊疗方案都是从病历中收集的,包括辅助检查、专家咨询,住院时间和差旅。最后统计住院、门诊专家预约、病例讨论、辅助检查的费用总和。

结果

在这一研究中,包括WES在内的医疗支出总额为澳元,说明三级诊疗时优先考虑WES的费用最低,通过对各种诊断流程成本效益的比较,证实了在三级诊疗时优先考虑WES的流程比传统诊断流程更有性价比。

讨论

该研究证实了WES在一些有症候群症状儿童中的临床实用性,为早期使用WES提供了充分的证据。当怀疑遗传异质性或有多个表型时,应进行前瞻性的进行WES。这一发现可能不仅反映了医生临床知识的缺乏,但也强调了WES在实际诊断的作用。

WES对治疗方案也有重要的临床意义,如6/23例(26%)改变了治疗方案,1/23例患儿停止了原本计划的检查,另1例患儿父母进行了产前植入前的基因诊断。治疗方案的变化包括并发症的监测,在确诊其他诊断时停止对可疑诊断的随访,以及对已知或正在发生的并发症进行专家评估。

该研究提示标准诊断流程的费用很高,早期应用WES可使成本效益最大化。对于具有复杂神经系统疾病的患儿,前期基因检测的费用占总费用的43%,即使没有前期基因检测的高费用,早期应用WES仍能使每个病人节约花费澳元,首次遗传学评估时查WES也比不查全外的标准诊断流程节省澳元。但课题组对费用的估算仍比较保守,因为不包括社区卫生人员进行的诊断检查费用。

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