生物大数据加速新型天然产物的发现

作者观点

1.生物学研究,获得对象的基因组(Genome)数据是必要条件

2.Genome本身只是数据,Genome-DrivenNothing

3.配合多种实验技术和分析策略,Genomics-DrivenAnything

4.新物质、新基因的鉴定可以参考如下若干策略

5.BGCs的发掘是合成生物学的前提条件

名词解释

NaturalProducts:天然产物,指以微生物或者植物细胞中的小分子化合物作为前体,衍生获得的药物化合物分子。如抗生素、药物前体、植物次生代谢产物等等,都属于天然产物。

BGCs:生物合成基因簇(BiosyntheticGeneClusters),天然产物具有非常丰富的化学结构多样性,但是编码的基因却组成较为保守的基因簇,在基因组中具有连续性和保守性。

OGs:直系同源基因对(OrthologousGroups),不同物种基因组中,编码相同或相似功能产物的基因组合。

背景介绍

天然产物是发掘新型抗生素的宝库

抗生素耐药性指细菌、病毒、真菌等微生物发生基因组变异,使原有针对性的治疗药物变得无效。由于多粘菌素的抗菌能力最强,所以其被视为抗生素中“最后一道防线”。但是在年科学家发现了多粘菌素抗药性菌株,让人类的最后一道防线岌岌可危。中国的抗生素使用量占全世界的一半,目前滥用抗生素的问题已经引发了国民的高度


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